پس از حمله به یک قایق ماهیگیری، تنها بازمانده خدمه متوجه می‌شود که این موجود کسی نیست جز یک گودزیلای احیاشده. با این حال، تلاش‌ها برای افشای این ماجرا توسط دولت ژاپن و در بحبوحه تنش‌های سیاسی فزاینده میان ایالات متحده و اتحاد جماهیر شوروی سرکوب می‌شود؛ چرا که هر دو کشور حاضرند برای متوقف کردن این هیولا، ژاپن را بمباران کنند.

پیدا شدن بازماندگان یک کشتی‌شکسته در جزیره اینفنت که گمان می‌رفت غیرمسکونی باشد، منجر به اعزام یک گروه علمی می‌شود. آن‌ها یک جمعیت بومی بازمانده را به همراه شوبيجين، پری‌های کاهنه و کوچک دوقلوی الهه افسانه‌ای جزیره به نام موترا، کشف می‌کنند. پس از اینکه پری‌ها توسط یک تاجر استثمارگر به نام کلارک نلسون ربوده می‌شوند، موترا برای نجات آن‌ها به راه می‌افتد.

جیروچوی آواره به طور تصادفی با ماجرای قتل احتمالی همسرش مواجه می‌شود و در حین فرار، ماجراهای دیگری را تجربه می‌کند.

جیروچو و پیروانش، گروه کوروکوما را تا استان کای تعقیب می‌کنند.