داستان این فیلم اکشن و مهیج درباره‌ی یک مامور جوان و تازه‌کار می‌باشد که از طرف رئیس خود برای آموزش دیدن ، کسب تجربه و همینطور زیر نظر گرفتن یک مامور سالخورده ، نزد وی فرستاده می‌شود. اما به زودی ماجرا عوض می‌شود و اتفاقاتی خارج از برنامه رخ می‌دهد و…

فیلم «کیدون» در صبح روز ۱۸ فوریه ۲۰۱۰ در تل‌آویو آغاز می‌شود؛ زمانی که تمام دنیا با دیدن تصاویر ماموران موساد روی صفحه اول روزنامه‌ها بیدار می‌شوند که یک ماه قبل در حال کشتن محمود المبحوح در دبی شکار شده‌اند. این اولین بار بود که دوربین‌های امنیتی ساده یک هتل، ماموران مخفی و آن هم ماموران اسرائیلی را در حین ارتکاب جرم غافلگیر می‌کردند. اما بدون شک، غافلگیرترین افراد، رهبران موساد بودند که به خوبی می‌دانستند آن سه مرد و یک زنی که چهره‌شان در تمام تحریریه‌های خبر جهان پخش شده، هیچ ارتباطی با آن‌ها ندارند. از آن پس، مسابقه‌ای با زمان آغاز می‌شود تا بفهمند چرا همه انگشت‌های اتهام به سمت آن‌ها نشانه رفته است.