ذخیره گرد طلای جادویی آقای کانداکتور که به او اجازه می‌دهد بین شاینینگ تایم و جزیره توماس سفر کند، به شدت رو به کاهش است. متأسفانه او نمی‌داند چگونه مقدار بیشتری از آن را به دست آورد. در همین حال، توماس در حال دفع حملات قطارهای دیزلی بدجنس است. به دست آوردن گرد طلای بیشتر به کمک پسرعموی تنبل آقای کانداکتور، دوست جدیدش لیلی و پدربزرگ غمگین او، به همراه یک قطار مخفی نیاز دارد.

توماس "سودور" را برای تحقق رویاهایش ترک می‌کند. این سفر ماجراجویانه توماس را مجبور به عبور از صحراها، جنگل‌ها و کوهستان‌های خطرناک می‌کند و ....

توماس در راه رساندن وسایل های مربوط به راه آهن به ایستگاه است اما در بین مسیر به او پیامی اشتباه مخابره می شود و باعث می شود او از مسیر خارج شود و ....