پس از سقوط از برج‌های دوقلو، کونگ به مدت ده سال در کما می‌رود. وقتی قلب او شروع به از کار افتادن می‌کند، دانشمندان یک قلب مصنوعی می‌سازند و یک میمون ماده غول‌پیکر را اسیر می‌کنند تا به عنوان منبعی برای انتقال خون از او استفاده کنند. وقتی کونگ پس از پیوند قلب بیدار می‌شود، حضور میمون ماده را در نزدیکی خود حس می‌کند و این دو برای ایجاد ویرانی با هم فرار می‌کنند.

وقتی دو برادر به نام‌های جاش و مایک برای تعطیلات به شهر کوچکی در جنوب می‌روند، متوجه می‌شوند که بیشتر ساکنان شهر یا مرده‌اند یا ناپدید شده‌اند. به زودی مایک نیز ناپدید می‌شود و جاش را تنها می‌گذارد تا با کلانتر محلی و معلم مدرسه متحد شود و او را در شهری که رازی تاریک و هولناک را پنهان کرده است، پیدا کند.